Институт осуществляет работы по организации и методическому руководству гидрохимическими наблюдениями на акваториях и побережьях морей России, а также выполняеть ежегодные оценки состояния и загрязнения морей России, включая Каспийское море обеспечивает научное сопровождение выполнения обязательств России по Тегеранской конвенции в части мониторинга и оценки морской среды